Coronavirus : SARS-CoV-2 – Wikipedia

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SRAS-CoV-2
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<p>Graphiques 3D du virion SARS-CoV-2
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<th>système
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<th>Caractéristiques taxonomiques
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génome: (+) ARNsb linéaire
couvrir: disponible
Nom scientifique Syndrome respiratoire aigu sévère Coronavirus 2 (Engl.) nom court SRAS-CoV-2 gauche

SRAS-CoV-2 (Sars-CoV-2; anciennement 2019 Ncov. 2019 nouveau virus Corona, "Novel Corona Virus 2019" et virus Wuhan(5)(6)(7)), est le nom d'un virus corona nouvellement identifié dans la ville chinoise de Wuhan dans la province du Hubei en janvier 2020. Le virus provoque la maladie appelée "Covid-19" (maladie du virus Corona 2019) et déclenche l'épidémie de coronavirus 2019/2020, classée par l'OMS comme "urgence sanitaire internationale".

En décembre 2019, une accumulation de pneumonie sévère de cause inconnue a été découverte dans la ville de Wuhan. Le 30 décembre 2019, le médecin chinois Li Wenliang a informé ses collègues médecins d'un groupe WeChat de sept patients soupçonnés d'être infectés par le virus du SRAS à l'hôpital central de Wuhan.(8) L'agence chinoise de contrôle des maladies CCDC (Centre chinois de contrôle et de prévention des maladies) a envoyé une équipe dans la ville le 31 décembre 2019.(9) Le même jour, le bureau chinois de l'Organisation mondiale de la santé (OMS) a été officiellement informé par les autorités chinoises qu'en décembre 2019, plusieurs personnes à Wuhan avaient contracté une pneumonie grave et que la cause était soupçonnée d'être un agent infectieux encore inconnu. Au 3 janvier 2020, un total de 44 patients avaient été signalés à l'OMS, dont plusieurs gravement malades. Parce que plusieurs personnes souffrant sur le plan local "Marché de poissons et fruits de mer de Chine méridionale" (chinois 武汉 华南 海鲜 批发市场, Pinyin Wǔhàn huánán hǎixiān pīfā shìchǎng – "Marché de gros de poissons et fruits de mer de Wuhan Huanan") en tant que vendeur ou commerçant, le principal site d'infection était suspecté sur ce marché.(10)(11)

Le 7 janvier 2020, le virologue chinois chef de file des virus Xu Jianguo (徐建国) savait que l'agent pathogène était un virus corona auparavant inconnu. Cela aurait entraîné des tests d'échantillons de sang et de prélèvements de gorge de 15 patients. Cette constatation a été confirmée dans une déclaration de l'OMS du 9 janvier 2020.(12)(13) Le 13 janvier 2020, la séquence complète du génome d'un isolat du nouveau virus corona a été déposée dans la NCBI GenBank (numéro GenBank MN908947).(14) Une première procédure de vérification a été publiée presque simultanément.(15)(16)(17)

Le terme «2019-nCoV» utilisé par l'OMS du 13 janvier au 11 février 2020 a été considéré comme «provisoire» selon l'OMS.(18) Le premier isolat de virus séquencé était dans la première description Coronavirus WH-Human-1 (WHCV) désigné (WH = Wuhan)(19) et comme Isoler le virus de la pneumonie du marché des fruits de mer de Wuhan Wuhan-Hu-1 ajouté à la base de données taxonomiques du NCBI (qui n'est pas pertinent pour les noms et classifications des virus). Le virus était alors là – également provisoirement – comme Virus de la pneumonie du marché des fruits de mer de Wuhan out; comme synonymes 2019 Ncov et Coronavirus de Wuhan mentionné.(20) Suggestions de noms, le virus basé sur MERS-CoV (Coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient) après le lieu de sa première identification, la ville de Wuhan, Coronavirus du syndrome respiratoire de Wuhan (WRS-CoV) n'ont pas été retenus par l'OMS. L'une des raisons invoquées par les experts était les plaintes formulées dans le passé lorsque des virus portaient le nom de pays ou régions individuels(21) (par exemple le virus de Marburg). L'OMS a donc émis des recommandations en 2015 sur la manière de nommer les nouveaux agents pathogènes et maladies. La désignation du lieu de découverte a été explicitement déclarée indésirable.(22)

Le 11 février 2020, l'OMS a annoncé que la maladie causée par le virus était "COVID-19" ou "Covid-19" (Maladie à virus Corona 2019) pour avoir nommé.(23)(24) Le même jour, le Groupe d'étude sur les coronavirus (CSG) des Comité international de taxonomie des virus (ICTV) sur le serveur de préimpression bioRxiv pour le virus, le nom SARS-CoV-2 (Syndrome respiratoire aigu sévère Coronavirus 2) suggéré.(4)

Génétique moléculaire et phylogénétique(éditer | Modifier le code source)

Comme cela est courant dans les coronavirus, le génome du virus est constitué d'ARN simple brin (ARNsb) avec une polarité positive. L'isolat Wuhan-Hu-1 (NCBI GenBank numéro MN908947(25)) comprend 29,903 nt (nucléotides) avec deux régions non traduites de 265 nt et 229 nt de long à l'extrémité 5 'et à l'extrémité 3'.(14) Les gènes putatifs (présumés) pourraient coder pour dix protéines: une polyprotéine ORF1ab longue de 7096 acides aminés (AS) (complexe de réplicase), une glycoprotéine de surface longue 1273 AS (S pour l'anglais pointes, comparer Peplomer), une protéine à poil long 75 AS (E pour Engl. enveloppe, comparer l'enveloppe du virus), une glycoprotéine de membrane longue 222 AA (M), une phosphoprotéine nucléocapside de longue durée 419 AA (N) et cinq autres protéines (ORF3a, ORF6, ORF7a, ORF8 et ORF10).(14) La séquence des gènes correspond à celle du virus du SRAS et à celle de tous les virus corona.(26)

Au 9 février 2020, il y avait maintenant un total de 21 analyses génomiques complètes des isolats du SRAS-CoV-2. La taille du génome se situe entre 29 825 et 29 903 nt.(25) La teneur en GC (la proportion des bases nucléiques guanine et cytosine) est de 38,0% en moles.(27)(28) Les deux virus isolent HKU-SZ-002a (NCBI GenBank numéro MN938384(25)) et HKU-SZ-005b (NCBI GenBank numéro MN975262(25)) proviennent de patients d'une famille de Shenzhen et ne diffèrent que par deux nucléotides. L'analyse du génome de ces deux isolats a montré qu'ils étaient étroitement liés à ceux des chauves-souris demandé) coronavirus de type SRAS survenant bat-SL-CoVZXC21 (NCBI GenBank numéro MG772934) et bat-SL-CoVZC45 (NCBI GenBank numéro MG772933), ces derniers étant identiques à 89% dans la séquence nucléotidique. Le génome des deux coronavirus de chauve-souris a été séquencé en 2018, bat-SL-CoVZC45 a été attribué à l'espèce Rhinolophus sinicus trouvés dans la famille des chauves-souris en fer à cheval (Rhinolophidae), les animaux hôtes ont été examinés à Zhoushan dans la province chinoise orientale du Zhejiang en 2015 et 2017.(28)

Un autre isolat de virus (WIV04, NCBI GenBank numéro MN996528(25)) du SRAS-CoV-2 du liquide d'irrigation broncho-alvéolaire de l'un des premiers patients présente également la plus grande similitude phylogénétique avec deux isolats de coronavirus provenant de chauves-souris chinoises.(19) Une analyse génétique publiée le 27 janvier 2020 a également qualifié les chauves-souris d'hôte présumé du virus.(29) Le 29 janvier 2020, il a été publié dans la revue The Lancet a publié une analyse génétique de dix échantillons de virus provenant de neuf patients. En conséquence, la séquence du génome des dix échantillons était identique à 99,98%, ce qui indique que la variante nouvellement découverte du coronavirus n'a été transférée que récemment à l'homme.(30)(31)
La séquence du génome correspond à 88 et 87% respectivement avec les séquences du génome de bat-SL-CoVZC45 et bat-SL-CoVZXC21 se produisant chez les chauves-souris. Les dix échantillons, par contre, ne montrent qu’environ 79% d’accord dans la séquence du génome avec le SRAS-CoV et environ 50% avec le MERS-CoV. Les résultats des études phylogénétiques sont également illustrés sous la forme d'un arbre phylogénétique.(28)(32) Une représentation basée sur ceci est dans l'article Beta coronavirus à trouver.

La structure du génome à la fois des isolats du SRAS-CoV-2 et des virus corona de chauve-souris mentionnés est typique des virus du Lignée B (Sous-genre Sarbecovirus. Anglais Virus bêta corona de type SRAS) du genre Beta coronavirus, En raison des distances génétiques au SARS-CoV et au MERS-CoV, le SARS-CoV-2 était initialement considéré comme nouveau en termes d'humains qui l'infectent. Beta coronavirusEspèces vues.(28)(32) En raison de la grande correspondance génétique avec l'original coronavirus du SRAS eu le 11 février 2019 Coronavirus Stdudy Group Cependant, l'ICTV a proposé le nouveau virus de la même espèce Coronavirus lié au syndrome respiratoire aigu sévère assigner comme le précédent.

morphologie(éditer | Modifier le code source)

Coupe transversale de 2019-nCoV

Les virus, qui ont été propagés dans une culture cellulaire pendant plusieurs jours, peuvent être préparés pour analyse au microscope électronique à transmission (TEM) après séparation par ultracentrifugation, en utilisant un contraste négatif. L'image TEM montre des virions de forme sphérique à pléomorphe avec un diamètre de 60 à 140 nanomètres (nm). Des pointes de 9 à 12 nm de long sont visibles en surface. La morphologie correspond à celle d'autres représentants bien connus de la famille des Coronaviridae. Les cellules hôtes, qui ont un effet cytopathique dans l'image microscopique lumineuse, peuvent également être examinées avec le MET après fixation et coupe ultramince ultérieure (épaisseur de 80 nm). En plus des virions, on trouve également des corps d'inclusion, qui contiennent des vésicules liées à la membrane remplies de virus dans le cytoplasme.(9)

Jusqu'à présent, le virus n'a été détecté que chez l'homme. Au début de l'épidémie, les experts soupçonnaient qu'un autre mammifère ou une volaille pourrait être l'hôte principal. Cependant, la transition des animaux aux humains aurait pu se faire via un hôte intermédiaire non encore identifié.(33) Des chercheurs chinois référencés dans ce contexte Journal of Medical Virology sur les serpents (krait multi-bandes et cobra chinois),(34)(35) qui sont proposés sur le marché de gros aux côtés d'autres animaux sauvages vivants (appelés "Ye Wei") tels que les chauves-souris ou les lapins.(36) Cette hypothèse a été déclarée peu probable par d'autres virologues, car il n'y a actuellement aucune preuve que les coronavirus peuvent également infecter les repitiles. Jusqu'à présent, les virus corona n'ont été trouvés que chez les mammifères et les oiseaux.(33) Après dans les pangolins malais (Anglais Pangolins de la Sonde) a coronavirus avec 99% de correspondance génétique, le SRAS-CoV-2 a été trouvé, ceux-ci sont de plus en plus suspectés d'être à l'origine de la nouvelle épidémie, d'autant plus qu'ils sont (malgré l'interdiction) commercialisés en Chine.(37)(38)

chemin de transmission(éditer | Modifier le code source)

Le 20 janvier 2020, la Commission chinoise de la santé a annoncé que la transmission de personne à personne était possible.(39) On pense que le virus se propage par le biais d'une infection par gouttelettes comme d'autres agents pathogènes respiratoires.(40) Le virus a jusqu'à présent été détecté dans les sécrétions nasales et pharyngées, dans les expectorations, les selles et le sang.(41)(28)

Il n'est pas clair si la transmission a lieu en touchant des surfaces et des objets contaminés.(42) Une analyse de 22 études portant sur la persistance de coronavirus médicalement pertinents (tels que SARS-CoV et MERS-CoV) sur des surfaces montre que ces virus persistent sur des surfaces en métal, en verre ou en plastique jusqu'à neuf jours à température ambiante peut. En moyenne, ils restent infectieux pendant quatre à cinq jours. Cependant, ils sont inactivés par des désinfectants appropriés (voir la section sur les mesures d'hygiène). Selon les scientifiques impliqués, ces résultats devraient être transférables à 2019-nCoV.(43)(44)

Sur la base de tests viraux quantitatifs dans la sécrétion du nasopharynx chez des patients présentant des symptômes très légers, les chercheurs de la Charité Virology et du Bundeswehr Institute for Microbiology ont conclu que même avec des symptômes très légers de la maladie, il existe un niveau élevé de capacité d'infection.(45) L'Institut Robert Koch fait également état de cas individuels dans lesquels les personnes affectées peuvent avoir contracté des personnes infectées qui ne présentaient aucun ou aucun symptôme spécifique.(13)

de reproduction de base(éditer | Modifier le code source)

L'analyse des données des 425 premiers cas à Wuhan a abouti à un nombre de reproduction de base de 2,2.(46) Un calcul de modèle avec des données de patients chinois et étrangers du 31 décembre 2019 au 28 janvier 2020 a montré une valeur de 2,68.(47) En comparaison, un taux de reproduction de base de 1,8 a été calculé pour le SRAS.(48) Afin d'empêcher la propagation du nCoV, la probabilité de transmission devrait être réduite d'environ 60% en prenant des mesures appropriées.

Part des cours sévères et de la mortalité(éditer | Modifier le code source)

L'OMS a donné avec elle Rapport de situation – 18e du 7 février 2020, par exemple, pour 31 211 personnes infectées confirmées en Chine, 4 821 patients (15,4%) atteints d'une maladie grave sont connus.(49) Cependant, aucune information précise sur la mortalité n'est actuellement possible. D'une part, la létalité peut être plus faible en raison des cas moins symptomatiques jusque-là inconnus. En revanche, les patients qui ne se sont pas encore rétablis peuvent toujours mourir et le taux de mortalité peut être plus élevé. Cela vaut également pour la proportion de parcours difficiles. Lorsque le diagnostic est posé, il n'est pas nécessaire de savoir si le patient est gravement malade ou même décède. Dans ce qui suit, certaines études sont citées qui donnent des indications de létalité.

Dans une analyse épidémiologique de 99 cas hospitalisés, 11% étaient décédés au 25 janvier 2020, 31% étaient sortis et 58% étaient toujours à l'hôpital.(50) Cette étude est une première indication que la létalité des patients hospitalisés est d'environ 11%.

Dans une étude publiée le 2 février 2020, la létalité des cas confirmés a été estimée. Le temps entre le début des premiers symptômes et le diagnostic (5,1 jours, IC à 95%: 3,5-7,5) et le temps entre le début des premiers symptômes et le décès (15,2 jours , IC 95%: 13,1-17,7) est pris en compte. Dans le premier scénario, l'épidémie a été calculée sur la base du patient index à partir du 8 décembre 2019 et une létalité de 4,6% (IC 95%: 3,1-6,6) a été calculée. Dans le deuxième scénario, une épidémie a été simulée sur la base des cas exportés vers d'autres pays et une létalité de 7,7% (IC à 95%: 4,9-11,3%) a été déterminée. Les auteurs soulignent que la létalité réelle des cas non diagnostiqués peut être proportionnellement plus faible.(51)

Une étude de cas d'un hôpital de Wuhan décrit 138 patients atteints de pneumonie confirmée radiologiquement et virologiquement en raison du 2019-nCoV du 1er janvier au 2 février 2020. Environ un quart de ces patients ont dû être traités en soins intensifs. La raison la plus courante du traitement intensif était le syndrome de détresse respiratoire aiguë, qui rendait la ventilation invasive nécessaire dans environ la moitié des cas. Les patients en soins intensifs étaient médicalement 66 ans plus âgés que le reste des patients médians 51 ans. À la fin de l'étude, environ 65% des patients étaient toujours à l'hôpital. Parmi les patients figuraient 40 employés de l'hôpital infectés au travail et 17 patients hospitalisés infectés dans l'établissement. La majorité des patients ont reçu de l'oseltamivir et des antibiotiques. 4,3% des patients sont décédés jusqu'à la fin de l'étude. Environ la moitié ont reçu des corticostéroïdes. D'après leur observation, les auteurs de l'étude ont décrit cette thérapie antivirale comme inefficace.(52)

période d'incubation(éditer | Modifier le code source)

La période d'incubation peut aller jusqu'à 14 jours(13) et est très similaire au SRAS. Une analyse des 425 premiers cas signalés à Wuhan a montré une période d'incubation de 5,2 jours en moyenne et un âge moyen de 59 ans. Les auteurs supposent que des transmissions interhumaines ont eu lieu autour du marché aux poissons à la mi-décembre.(46)

L'infection d'autres personnes pendant la période d'incubation est possible malgré l'état de santé. Les tests de charge virale dans le sang de patients individuels suggèrent que certains patients peuvent continuer à être temporairement infectieux pendant la récupération clinique avec une amélioration clinique.(53) Les rapports de cette publication, qui sont basés sur l'hypothèse d'un patient index chinois asymptomatique, ont été recherchés par la revue science réfuté et maintenant également interrogé par le RKI.(54)

Un cas subjectivement asymptomatique d'un garçon de dix ans à Shenzhen, dont le laboratoire de base était banal, est également décrit. Au cours de l'enquête approfondie, cependant, les résultats radiologiques se sont avérés compatibles avec la pneumonie et l'ARN du virus a été détecté dans le prélèvement de gorge.(28)

pathogénèse(éditer | Modifier le code source)

Comme pour le SRAS, le virus pénètre dans la cellule humaine via le récepteur ACE2.(19)

Une fiche d'information du ministère allemand des Affaires étrangères mentionne que les rapports «provenant de chaînes d'infection au-delà de la quatrième génération» sont disponibles en Chine.(55)

Étant donné que ce type de virus n'a été détecté qu'en janvier 2020, il n'existe à ce jour que les premières descriptions de cas. La différenciation des autres maladies virales telles que la grippe est difficile. Après une période d'incubation pouvant aller jusqu'à 14 jours(13) de la fièvre, des myalgies et une toux sèche peuvent survenir. La maladie se manifeste souvent par une sensation générale et sévère de maladie ainsi que des maux de dos.(28) Contrairement aux infections par des coronavirus inoffensifs, les symptômes des voies respiratoires supérieures sont plutôt rares et les symptômes du tube digestif, comme cela a été observé plus fréquemment dans le SRAS, ne se produisent que dans quelques cas. Dans le cours ultérieur, un essoufflement grave peut se développer en raison d'une infection des voies respiratoires inférieures jusqu'à la pneumonie.(56) Cela peut s'accompagner de douleurs thoraciques dans le sens d'une pleurésie. La majorité des patients ont montré la combinaison d'une diminution du nombre total de globules blancs, d'une diminution des lymphocytes et d'une augmentation des paramètres d'inflammation chimique en laboratoire typiques des infections virales sévères. L'imagerie dans la tomodensitométrie des poumons a révélé un ombrage de verre dépoli des deux côtés comme signe de bronchopneumonie.(56)

La majorité des premières hospitalisations des patients sont survenues après environ une semaine de maladie symptomatique due à une aggravation de la maladie. Dans les cas où un traitement médical intensif est devenu nécessaire, le besoin est apparu une dizaine de jours après le début des symptômes.(56)

Dans une étude épidémiologique de 99 cas hospitalisés, une ventilation non invasive a été utilisée chez 13 patients, une ventilation invasive chez quatre patients, une dialyse due à une insuffisance rénale chez neuf patients et un soutien pulmonaire extracorporel (ECMO) chez trois patients.(50)

Une différence majeure par rapport au coronavirus du SRAS est que les patients peuvent être infectieux quelques jours avant le début des symptômes de la maladie (contrairement au coronavirus du SRAS, les patients n'étaient infectieux qu'après l'apparition des symptômes). L'infection est donc plus difficile à identifier et plus difficile à contenir. Pour les mesures de quarantaine, il ne suffit donc pas d'isoler uniquement les personnes cliniquement visibles.(31)

RT-PCR(éditer | Modifier le code source)

Le virus peut être détecté directement dans les expectorations, dans la sécrétion trachéale, dans le liquide d'irrigation bronchoalvéolaire et dans le frottis nasopharyngé au moyen de RT-PCR (reverse transcriptase polymerase chain reaction). L'examen de laboratoire en Allemagne est effectué par le laboratoire consultant pour les virus corona à la Charité de Berlin. Cet examen est recommandé sur la base de deux critères:(57)

  1. pour les personnes soupçonnées de pneumonie et de rester dans la zone à risque 14 jours avant le début de la maladie;
  2. pour les personnes symptomatiques qui ont été en contact avec un cas confirmé.

Jusqu'au développement de la détection indirecte (détection d'anticorps)(31)(58) le sérum sanguin des personnes affectées doit être conservé.(57) (Au 23 janvier 2020)

La méthode de détection de la Charité est la réaction quantitative en chaîne de la transcriptase inverse en temps réel (abrégée en qRT-PCR ou RT-qPCR). Il est basé sur la détection de deux séquences nucléotidiques, désignées comme e Gène et RdRp Général Le premier gène code pour l'enveloppe virale (E pour Engl. enveloppe 'Envelope'), le deuxième gène de l'ARN polymérase dépendante de l'ARN (RdRP pour Engl. ARN polymérase ARN dépendante). Le coronavirus associé au SRAS et d'autres coronavirus associés au SARS associés à la chauve-souris (SARS-CoV) ont été utilisés pour la conception de l'amorce. La première version du test RT-PCR en temps réel a été créée avant la publication de la séquence du génome nCoV 2019. Après leur publication, les amorces ont été sélectionnées qui conviennent également à la détection du 2019-nCoV. Le premier essai (e Gen) sert de criblage car il existe plusieurs espèces de virus du sous-genre Sarbecovirus (du genre Beta coronavirus) le prouve. Si ce test est positif, un test de confirmation (RdRp Gène). Si un résultat positif est également obtenu ici, la troisième étape est un essai de caractérisation (également RdRp Gene). Les deux derniers tests utilisent une sonde génique spécifique au 2019-nCoV, le deuxième test contient également une sonde qui correspond à la séquence nucléotidique de la section ARN du SARS-CoV et du 2019-nCoV.(17)(59)

Si les résultats sont positifs, le traitement doit être démarré. Si le résultat est négatif, mais qu'il existe toujours une forte suspicion d'infection par le nouveau virus corona, l'Institut Robert Koch recommande de répéter le diagnostic. Si le résultat est à nouveau négatif, l'infection au nCoV est exclue. Si le diagnostic ne peut pas être effectué dès le départ, le laboratoire de consultation doit être à nouveau consulté.(60)

La méthode de détection biologique moléculaire utilisée dans le laboratoire de conseil de la Charité a été développée rapidement et efficacement; la première version était déjà disponible le 13 janvier 2020. Les scientifiques chinois ont volontiers contribué à ces découvertes. Les données fondamentales provenaient de réseaux de recherche internationaux et la section mondiale des archives européennes de virus (Global, EVAg) a fourni les produits nécessaires (ARN du SARS-CoV et transcriptions d'ARN) pour les tests.(59) D'autres groupes de scientifiques ont également publié leurs méthodes développées. Il s'agit de protocoles de PCR ou de listes d'amorces appropriées et de leur concentration en substance utilisée pour la RT-PCR, par exemple des Centers for Disease Control and Prevention (CDC) aux États-Unis, du CDC en Chine ou de l'Université de Hong Kong. Ils diffèrent dans les gènes de l'ARN du virus qui sont détectés.(61) Au lieu de la variante quantitative en temps réel, les produits de la PCR de transcriptase inverse peuvent également être détectés en utilisant une électrophorèse sur gel d'agarose.(28)

Autres méthodes(éditer | Modifier le code source)

Les laboratoires équipés pour l'analyse du génome (séquençage de l'ADN du génome) peuvent également identifier le 2019-nCoV de cette manière.(62) Des analyses complètes du génome des isolats de nCoV 2019 à des fins de comparaison sont disponibles, par exemple, dans la base de données génétiques du National Center for Biotechnology Information (NCBI) ou via la plateforme GISAID(63) disponibles (voir section génétique moléculaire).

Selon l'Organisation mondiale de la santé (OMS), un processus biologique moléculaire simplifié, la technologie d'amplification des acides nucléiques (TAAN) est en cours de développement, les tests sont actuellement en cours de validation (au 17 janvier 2020). La méthode NAAT est également basée sur la RT-PCR, mais le test prêt à l'emploi offre l'avantage d'être plus facile à utiliser et peut être utilisé par des laboratoires de routine bien équipés.(62)

Le 5 février 2020, l'agence américaine CDC a annoncé un tel essai (kit de test) être mis à la disposition des laboratoires de diagnostic accrédités. Le test est appelé Centers for Disease Control and Prevention (CDC) 2019-Novel Coronavirus (2019-nCoV) Real-Time Reverse Transcriptase (RT) -PCR Diagnostic Panel désigné et est destiné à la détection du nouveau coronavirus et des coronavirus de type SRAS dans des échantillons des voies respiratoires supérieures et inférieures des patients. Auparavant, l'autorité sanitaire avait accordé une approbation accélérée Administration d'aliments et de médicaments (FDA), de sorte que le test peut également être utilisé en dehors des installations de recherche.(64) Un kit de test permet l'examen de 700 à 800 échantillons, 100 de ces colis sont destinés à des laboratoires américains, 100 autres à des laboratoires internationaux qui, par exemple, effectuent des tests pour le compte de l'OMS.(65) Auparavant, Xinhua, l'agence de presse gouvernementale de la République populaire de Chine, avait signalé aux autorités chinoises Administration nationale des produits médicaux (NMPA) a approuvé une procédure d'essai le 26 janvier. Le test provient de la société de biotechnologie Sansure Biotech développé à partir de Changsha. Avec l'aide de l'automatisation de laboratoire appropriée, les résultats des tests devraient déjà être disponibles après 30 minutes.(66)

Selon l'OMS, la détection d'anticorps comme test sérologique est également en cours de développement (au 17 janvier 2020). Cela se traduira par un dosage (par exemple un dosage immunologique tel que ELISA) avec lequel des anticorps provenant d'échantillons de patients (sérum sanguin) peuvent être détectés par une réaction antigène-anticorps. L'OMS et l'Institut Robert Koch (RKI) en Allemagne demandent la collecte et la conservation d'échantillons de sérum provenant de cas confirmés ou suspectés en phase aiguë.(57) L'OMS recommande de prélever le premier échantillon au cours de la première semaine de maladie et le deuxième échantillon trois à quatre semaines plus tard. Cela permet de vérifier une séroconversion.(62)(67)

culture cellulaire(éditer | Modifier le code source)

Le virus a été propagé avec succès dans une culture cellulaire à des fins de recherche dans des pays comme la Chine, l'Australie, la France, l'Allemagne et les États-Unis.(9)(58)(68)(69)(70) Les scientifiques chinois utilisent des cellules épithéliales des voies respiratoires humaines qui simulent le tissu épithélial mucociliaire multicouche (épithélium cilié), ainsi que les lignées cellulaires Vero E6 et Huh-7.(9)

Aucun traitement spécifique n'est actuellement disponible, tout au plus les symptômes peuvent être atténués; cependant, certains antiviraux existants, qui sont utilisés contre le MERS-CoV et le VIH, par exemple, peuvent également être efficaces lorsqu'ils sont infectés par le 2019-nCoV.(71)(72)(73) Il s'agit notamment des inhibiteurs de protéase tels que l'indinavir, le saquinavir, le remdesivir, le lopinavir / ritonavir et l'interféron bêta.(74)(75) De plus, immédiatement après la publication de la séquence d'ARN du virus, plusieurs laboratoires ont commencé à développer un vaccin contre le virus.(76)

La Commission nationale de la santé de la RPC recommande une combinaison des inhibiteurs de la protéase du VIH lopinavir et ritonavir et de l'interféron alpha inhalé. Aux États-Unis, l'analogue nucléotidique remdesivir, qui a été développé pour lutter contre la fièvre Ebola, a été utilisé. Une preuve d'efficacité est toujours en attente.(77)

population générale(éditer | Modifier le code source)

Le 28 janvier 2020, l'Institut Robert Koch a donné des conseils à la population générale sur la manière de réduire considérablement le risque d'infection. Les principaux points à noter ici sont:

  • assurer une bonne hygiène des mains (y compris se laver les mains avec du savon: avant de manger, après un contact avec d'autres personnes, après être allé aux toilettes, après avoir éternué / toussé)
  • garder une distance minimale d'environ 1 mètre des personnes suspectées
  • étiquette de toux correcte (toux ou éternuement dans le creux du bras si possible, pas dans la main)

Les masques respiratoires, en revanche, sont principalement recommandés pour les malades eux-mêmes ou pour les soignants qui sont en contact étroit avec les malades. Il n'a pas été scientifiquement prouvé si le port d'une protection bouche-nez en public réduit considérablement le risque d'infection.(13)

Personnel médical(éditer | Modifier le code source)

Le 24 janvier 2020, l'Institut Robert Koch a donné les premières indications quant aux mesures d'hygiène nécessaires pour éviter la transmission du pathogène par les gouttelettes au personnel médical. Les mesures de protection recommandées consistent notamment à porter une blouse de protection à manches longues, des lunettes de protection, un masque respiratoire au moins conforme à la norme FFP2 et des gants de protection. Les désinfectants conviennent à la désinfection chimique des mains et des surfaces "Virucide limité". "Virucidal PLUS limité" ou « Virucide » couverture.(78)(79) Une analyse de 22 études portant sur la persistance et l'inactivation de coronavirus médicalement pertinents (tels que le SRAS-CoV et le MERS-CoV) dans les établissements de santé, entre autres, montre que des agents à base d'éthanol, de peroxyde d'hydrogène ou d'hypochlorite de sodium sont utilisés pour la désinfection des surfaces une concentration appropriée est efficace.(43) Neben der konsequenten Einhaltung der Basishygiene zählen außerdem die Unterbringung in einem Isolierzimmer möglichst mit Schleuse bzw. in einem Einzelzimmer mit eigener Nasszelle und das Abstellen eventuell vorhandener raumlufttechnischer Anlagen, über die ein Luftaustausch mit anderen Räumen möglich ist, zu den empfohlenen Hygienemaßnahmen.(60)

Dieser Artikel beschreibt ein aktuelles Ereignis. Die Informationen können sich deshalb rasch ändern.

Nachdem der WHO bis zum 3. Januar 2020 insgesamt 44 Erkrankte gemeldet worden waren, verstarb am 9. Januar 2020 (Ortszeit) erstmals einer der Erkrankten, ein 61-jähriger Mann,(80) und am 15. Januar 2020 verstarb ein zweiter Erkrankter (im Alter von 69 Jahren) an den Folgen der Virusinfektion.(81)

Am 13. Januar 2020 wurde der erste Erkrankungsfall außerhalb Chinas bekannt. Es handelte sich um eine aus Wuhan am 8. Januar 2020 nach Bangkok (Thailand) eingereiste 61-jährige Frau.(82)(83)

Am 20. Januar 2020 berichteten die chinesischen Behörden über einen starken Anstieg der Neuerkrankungen mit 139 neuen Fällen am 18./19. Januar 2020, davon einige auch außerhalb Wuhans in Shenzhen und Peking. Ein weiterer durch das Virus verursachter Todesfall und der erste Fall aus Südkorea wurden gemeldet.(84) Die chinesischen Behörden bestätigten zudem, dass sich Infektionen durch Mensch-zu-Mensch-Übertragung ereignet hatten.(13)(28)

An den folgenden Tagen wurden der WHO täglich neue Erkrankungen aus China gemeldet, die Anzahl der Erkrankten erhöhte sich bis zum 26. Januar 2020 weltweit auf mehr als 2000 und die Anzahl der Todesfälle auf mehr als 50.(85) Auch an den folgenden Tagen erhöhten sich die gemeldeten Fallzahlen sprunghaft, so dass am 31. Januar 2020 bereits fast 10.000 Infizierte und mehr als 200 Todesfälle(86) und am 10. Februar 2020 mehr als 40.000 Infizierte und mehr als 900 Todesfälle(87) der WHO gemeldet worden waren.

Am 27. Januar 2020 wurden erstmals auch in Deutschland Infektionen nachgewiesen.(88) Zunächst bei einem 33-jährigen Mann aus dem Landkreis Landsberg am Lech, der von einer Chinesin – der Indexpatientin – infiziert worden war, die sich vom 19. bis 22. Januar auf Dienstreise in dem Unternehmen Webasto SE in Bayern aufgehalten hatte. Zunächst hatte es geheißen, bei ihr seien Anzeichen für eine Infektion erst während des Rückflugs nach China aufgetreten;(53) tatsächlich hatte sie aber bereits zuvor aufgrund erster Symptome fiebersenkende Mittel eingenommen.(54) Bereits am Abend des 28. Januar wurde bekannt gegeben, dass sich auch drei Kollegen des 33-Jährigen mit 2019-nCoV infiziert hatten.(89) An den folgenden Tagen wurde das Virus bei mehreren Kontaktpersonen der Indexpatientin und bei Angehörigen der in Bayern infizierten Personen nachgewiesen, darunter ein fünfjähriges Kind.(90)(91)

Am Abend des 30. Januar 2020 erklärte die Weltgesundheitsorganisation (WHO) die Epidemie zu einer Gesundheitlichen Notlage internationaler Tragweite.(92)

In Deutschland ist laut Infektionsschutzgesetz (§ 6) das Auftreten einer bedrohlichen übertragbaren Erkrankung an das zuständige Gesundheitsamt zu melden. Mit Wirkung vom 1. Februar 2020 wurde mittels Verordnung durch das Bundesministerium für Gesundheit (Verordnungsermächtigung nach § 15 IfSG) eine Ausdehnung der Meldepflicht beschlossen. Demnach sind sowohl der Verdacht einer Erkrankung, die Erkrankung und der Tod als auch der laborchemische Nachweis einer akuten Infektion mit dem neuartigen Coronavirus meldepflichtig. Die Meldung des Verdachts hat nur zu erfolgen, wenn der Verdacht sowohl durch das klinische Bild als auch durch einen wahrscheinlichen epidemiologischen Zusammenhang begründet ist. Diese Verordnung gilt bis zum 1. Februar 2021, sofern nicht mit Zustimmung des Bundesrates etwas anderes verordnet wird.(93)

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