Coronavirus : NYC ouvre son propre laboratoire de test de coronavirus

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Après des mois de plaintes concernant les retards dans les tests, les responsables de la ville de New York devraient annoncer jeudi qu’ils ont ouvert un laboratoire à Manhattan qui devrait réduire considérablement les temps d’attente alors que la ville se prépare pour sa période de réouverture la plus ambitieuse, avec des cours dans les écoles publiques. et les repas à l’intérieur devraient commencer ce mois-ci.

Plutôt que de dépendre des grandes entreprises de laboratoire – qui ont été inondées par la demande de tout le pays alors que le virus continue de se propager, entraînant des arriérés – la nouvelle installation donnera la priorité aux résidents de New York, ce qui signifie des délais d’exécution dans les 24 à 48 heures, selon les responsables. m’a dit.

Dans quelques semaines, il devrait être en mesure de traiter plus de tests pour les résidents de la ville que tout autre laboratoire, un point lumineux rare pour les New-Yorkais, qui depuis mars ont connu de nombreux problèmes en essayant de se faire tester pour le coronavirus.

«Cela nous donnera plus de capacité uniquement en termes de chiffres», a déclaré le Dr Jay Varma, un conseiller de la mairie qui joue un rôle de premier plan dans la réponse aux coronavirus de la ville. «Cela nous donnera également le contrôle car c’est un laboratoire vraiment dédié à New York.»

La ville de New York possède l’un des programmes de dépistage des coronavirus les plus ambitieux du pays, utilisant plus de 200000 personnes par semaine, soit plus de 2% de tous les habitants de la ville. Le nouveau laboratoire, qui a commencé à traiter les tests cette semaine, devrait éventuellement contribuer à développer considérablement ce domaine.

Le laboratoire, au 12ème étage d’un immeuble de la First Avenue et East 29th Street, est géré par Opentrons, une petite entreprise de robotique. Mais New York a joué un rôle important dans la création du laboratoire, ont déclaré des responsables de la ville. Pour l’instant, la ville et son réseau hospitalier public sont les seuls clients du laboratoire.

Dans un premier temps, le nouveau laboratoire, qui s’appelle le laboratoire d’intervention en cas de pandémie, ne traitera que quelques milliers de tests par jour, principalement à partir d’échantillons prélevés sur des sites de test gérés par le système hospitalier public de la ville, ont déclaré des responsables de la mairie et d’Opentrons.

Mais on s’attend à ce que le laboratoire soit à terme en mesure de tester plus de 40 000 échantillons par jour, dont certains provenant d’élèves et d’enseignants des écoles publiques, selon les besoins.

Mercredi matin, le laboratoire avait renvoyé les résultats des 712 premiers échantillons qu’il avait été envoyés et est actuellement en mesure de traiter environ 3000 échantillons par jour, un nombre qui devrait augmenter considérablement au cours de la semaine prochaine, a déclaré un porte-parole du laboratoire. .

Les responsables de la santé publique espèrent que les tests ne seront plus – pour la première fois depuis l’arrivée du coronavirus à New York – une ressource rare.

Le nouveau laboratoire est le dernier chapitre des efforts de longue date de la ville pour résoudre une série de problèmes qui affligent les efforts de test. Les problèmes remontent à février et mars, lorsqu’une série de faux pas et de décisions désastreuses du gouvernement fédéral ont signifié que peu de personnes se sont qualifiées pour un test – même lorsqu’elles présentaient des symptômes clairs de Covid-19 – alors que le virus commençait à circuler à travers New York et sa banlieue.

Au début, le gouvernement fédéral avait le monopole des tests et la ville s’est efforcée de développer la capacité de tester elle-même. Au début, l’effort a été entravé par le manque de kits de test, de réactifs chimiques et même des écouvillons utilisés pour collecter les échantillons.

Dans les mois qui ont suivi, les plus grands laboratoires nationaux ont considérablement augmenté leur capacité de test et New York a commencé à compter sur eux pour gérer la plupart des tests locaux. Mais certains de ces laboratoires, comme Quest Diagnostics, ont été débordés cet été au milieu d’une aggravation des épidémies ailleurs dans le pays.

Cela a contribué à des temps d’attente allant jusqu’à 2 à 3 semaines pour les résultats des tests à New York. Pour les responsables de la santé publique, il était clair que la ville de New York avait besoin de plus d’infrastructures de test qu’elle pourrait contrôler – ou du moins sur laquelle s’appuyer.

« Nous allons entrer dans l’échelle de la capacité de test que nous estimons essentielle », a déclaré le Dr Varma.

La capacité supplémentaire pourrait être utile dans le cadre de la prochaine pression pour que les élèves et les enseignants se fassent tester alors que l’enseignement en classe reprend pour des centaines de milliers de personnes dans le système scolaire public. Et à mesure que la saison de la grippe commence et que le rhume a commencé à circuler en plus grand nombre, la demande de tests peut augmenter, car les New-Yorkais font face à des symptômes qui pourraient ou non signifier Covid-19.

«Nous savions que nous avions vraiment besoin de notre capacité de test pour être au maximum à l’automne», a déclaré le Dr Varma.

Opentrons, la société de robotique qui dirigera le laboratoire, est spécialisée dans l’automatisation des laboratoires de recherche. Jonathan Brennan-Badal, PDG de la société, a déclaré que trois bras robotiques déplaceraient des plateaux, chacun contenant quelque 380 échantillons, entre différentes stations de test.

Le laboratoire prévoit de commencer à regrouper les échantillons, une méthode où un certain nombre d’échantillons sont regroupés et testés en un seul.

James Patchett, le président de la société de développement économique de la ville, a exprimé l’espoir qu’avec la mise en commun, le laboratoire serait en mesure de tester à terme de 40 000 à 60 000 échantillons par jour.

La pression pour le laboratoire remonte au début avril, au plus fort de l’épidémie, lorsque la mairie s’est rendu compte qu’elle faisait face à une pénurie de fournitures critiques.

Mois après mois, le programme de test de la ville est resté un maillon faible dans sa capacité à répondre au coronavirus.

La ville elle-même a eu une capacité limitée pour traiter les tests. Il y avait le propre laboratoire de santé publique du Département de la santé, ainsi que du matériel de test rapide dans diverses cliniques de santé sexuelle et hôpitaux publics gérés par la ville. Au total, la ville pourrait traiter elle-même environ 10 000 tests par jour, a déclaré Jeff Thamkittikasem, directeur du bureau des opérations du maire.

Le maire Bill de Blasio a évoqué l’ambition de la ville de tester 50 000 New-Yorkais par jour d’ici la fin de l’été.

Depuis des mois maintenant, la mairie et l’agence de développement économique de la ville discutent avec des sociétés de laboratoire et des entreprises en démarrage pour renforcer la capacité de laboratoire consacrée à la gestion des tests à New York.

Le nouveau laboratoire s’appuiera en partie sur un processus qui a été développé par des chercheurs en génétique du NYU Langone Medical Center, a déclaré M. Brennan-Badal, directeur général d’Opentrons. En plus de permettre des tests à haut volume, le processus consomme également relativement moins de réactifs et d’autres fournitures qui ont été rares à divers moments de la pandémie, a-t-il déclaré.

La ville paiera 28 $ à Opentrons pour chaque test, ce qui, selon M. Brennan-Badal, représentait moins d’un tiers de ce que certains autres laboratoires facturaient.

M. Thamkittikasem, l’aide aux opérations du maire, a déclaré que le plan était que le laboratoire teste également des échantillons pour la grippe.