Coronavirus : La prochaine étape dans la lutte contre la nouvelle couronne: des laboratoires mondiaux tentent d'analyser des échantillons de virus vivants-IT & health-cnBeta.COM

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Les scientifiques ont besoin d'échantillons de virus vivants pour explorer les mécanismes biologiques des nouvelles infections à coronavirus et développer des méthodes de détection, des médicaments et des vaccins. Rien n'indique que la nouvelle épidémie de coronavirus s'atténue. Les virologues du monde entier sont impatients d'obtenir des échantillons physiques du virus. Ils prévoient de tester des médicaments et des vaccins, de développer des modèles d'infection animale et d'étudier les problèmes biologiques du virus, tels que la façon dont le virus est transmis.

Source: Dr Linda Stannard / UCT / Photothèque scientifique

"Dès que nous avons appris l'épidémie, nous avons commencé à envoyer du personnel d'échantillonnage pour obtenir ces isolats de virus", a déclaré Vincent Munster, virologue à l'Institut national des allergies et des maladies infectieuses (NIAID). Son laboratoire devrait obtenir des échantillons des Centers for Disease Control and Prevention (CDC) la semaine prochaine. Le CDC est chargé de diriger la réponse aux nouvelles infections à coronavirus aux États-Unis.

Le premier laboratoire à isoler et étudier un nouveau coronavirus (provisoirement appelé "2019-nCoV") est venu du centre de l'épidémie, à Wuhan, en Chine. Une équipe dirigée par le virologue Shi Zhengli de l'Institut de virologie de Wuhan a isolé le virus d'une femme de 49 ans. La femme a développé des symptômes le 23 décembre 2019 et a été gravement malade par la suite. L'équipe de Shi Zhengli a découvert que le nouveau coronavirus utilise un récepteur moléculaire pour entrer et tuer les cellules humaines cultivées, qui est le même récepteur moléculaire utilisé par le coronavirus du SRAS.

Le 28 janvier, un laboratoire australien a annoncé qu'il avait isolé un échantillon de virus d'une personne infectée rentrée de Chine et se prépare actuellement à le partager avec d'autres scientifiques. Bart Haagmans, virologue au centre médical Erasmus de Rotterdam, aux Pays-Bas, a déclaré que des laboratoires en France, en Allemagne et à Hong Kong isolent également les échantillons de virus qu'ils ont obtenus de patients locaux et les partagent publiquement avec leurs pairs. "Peut-être pourrons-nous obtenir des isolats de virus d'autres laboratoires la semaine prochaine", a-t-il déclaré.

Séquences et échantillons

Depuis que la première séquence génomique du nouveau coronavirus a été rendue publique début janvier, des dizaines de séquences ont été publiées à ce jour (provenant de différentes populations). Ces séquences ont permis de réaliser des tests diagnostiques du virus et d'étudier la propagation et l'évolution du pathogène. Mais les scientifiques disent que les séquences génomiques ne remplacent pas les échantillons de virus, et que les échantillons de virus sont essentiels pour les tests de médicaments et de vaccins et pour une étude approfondie des virus. "Partager des échantillons de virus est essentiel", a déclaré le 29 janvier Maria Van Kerkhove, épidémiologiste des maladies infectieuses à l'Organisation mondiale de la santé.

Munster a déclaré que la première priorité de son laboratoire était d'identifier les animaux qui sont similaires à la façon dont les humains sont infectés par le nouveau coronavirus. Ces modèles animaux peuvent être utilisés pour tester les effets des vaccins et des médicaments. L'équipe a d'abord prévu d'étudier une souris qui a été génétiquement modifiée pour contenir des récepteurs humains que le virus du SRAS et un nouveau coronavirus utilisent pour infecter les cellules. Il a ajouté que la prochaine étape pourrait être de tester le vaccin contre l'infection chez la souris, y compris l'exposition subséquente de primates non humains au nouveau coronavirus.

Le laboratoire de Munster espère également évaluer le temps de survie du nouveau coronavirus dans l'air ou la salive dès que possible. Cela aide les épidémiologistes à comprendre si le virus peut être transmis par voie aérienne ou uniquement par contact étroit. La recherche de Munster utilisera un conteneur appelé "Goldberg drum", qui utilise les particules virales pour être atomisé et ensuite autorisé à rester dans l'air pendant une période de temps pour mesurer sa capacité à infecter les cellules humaines.

Ces expériences seront menées dans le cadre de mesures d'isolement strictes, c'est-à-dire pour répondre au troisième niveau des normes de biosécurité, pour empêcher les travailleurs de laboratoire d'être infectés et pour éviter les fuites accidentelles d'agents pathogènes. Il existe des milliers de ces laboratoires dans le monde, mais Munster souligne que de nombreuses recherches sur les virus n'ont pas besoin d'être menées dans des conditions de biosécurité aussi strictes pour accélérer la recherche.

Suivi de la propagation du virus

L'une des premières tâches de Haagmans est de développer un test sanguin pour détecter les anticorps dirigés contre un nouveau coronavirus. Ce type de test peut identifier ceux qui ont été exposés au 2019-nCoV, mais qui ne sont plus infectés et peuvent ne jamais présenter de symptômes.

Son équipe de recherche souhaite également savoir si un animal comme le furet peut être utilisé comme modèle d'infection humaine. Les chercheurs utilisent des animaux pour étudier la grippe et d'autres maladies respiratoires parce que leurs poumons sont physiologiquement similaires aux humains et sont sensibles à certains des mêmes virus. Haagmans veut tester si le nouveau coronavirus peut se propager entre ces animaux afin d'obtenir des indices sur la transmission interhumaine.

Bon nombre des problèmes liés au nCoV 2019 que les virologues envisagent d'étudier sont basés sur les résultats antérieurs du SRAS et du virus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient. Par exemple, il semble qu'une protéine requise pour les cellules infectées par le virus du SRAS a été adaptée pour faciliter l'entrée dans les cellules humaines.

Actuellement, Haagmans tente toujours d'obtenir son premier échantillon de virus, mais il espère qu'à mesure que l'épidémie se développera, il pourra obtenir quelques échantillons supplémentaires pour suivre et étudier si ce nouveau coronavirus a évolué et comment il a évolué. "Nous devons mieux comprendre les propriétés biologiques des nouveaux coronavirus, en particulier pour savoir en quoi ils diffèrent des virus connus", a-t-il déclaré. "C'est ce que nous voulons faire".

Références:

1. Zhou, P. et al. Preprint at bioRxiv https://doi.org/10.1101/2020.01.22.914952 (2020).

Remarques: La vidéo originale en anglais a l'adresse: https://www.youtube.com/watch?time_continue=15&v=qTt3P5V8M1A&feature=emb_logo

L'article original était intitulé China coronavirus: les laboratoires du monde entier se démènent pour analyser des échantillons vivants et publié dans la section des nouvelles de Nature le 31 janvier 2020

© nature

Nature | doi: 10.1038 / d41586-020-00262-7